分子修饰分析

翻译后修饰分析(或核苷酸修饰):

翻译后修饰是调节蛋白质功能的重要方式,对蛋白质翻译后修饰的研究可以帮助阐明和了解蛋白质功能及其功能变化,翻译后修饰的预测和分析也日渐成为生物信息学蛋白质序列分析中的重要的研究内容。修饰包括磷酸化、糖基化、甲基化、泛素化和羟基化等。



预测蛋白质修饰的软件有很多,各有优缺点。我们将进化保守性(position specific scoring matrix,PSSM),蛋白质无规则卷曲,蛋白二级结构和亲和性,氨基酸组成和氨基酸物理属性(分子量大小,极性,带电量,结构)以及编码密码子的频率考虑进去,并且进行特征筛选(feature selection)选出最优特征,然后利用最优特征进行预测,可以达到很高的预测准确度。相关方法已在国际期刊发表多篇论文。同时也可以利用这些特征将蛋白质进行聚类分析。