代谢组分析

质谱作为医学代谢组学研究的重要高通量平台,可以用于:

1、疾病诊断和生物标志物发现: 通过对比疾病组和对照组血液、尿液、粪便或其他体液类型样本进行以LC-MS/MS为基础的代谢全谱分析,可以筛选和鉴定候选的生物标志物;

2、 靶标分析: 通过分析检测病人血液、尿液或其他体液中一种或几种目标疾病代谢标志物来实现疾病筛查。

分析内容:

利用LC-MS/MS液质联用技术进行代谢组学分析和差异代谢物筛选。主要包括:单因素分析-T检验、PCA分析(主成分分析法)、PLS-DA分析(偏最小二乘法分析)、OPLS-DA分析(正交偏最小二乘法分析)、聚类分析、相关性分析、ROC分析等。


上图为整个实验流程,包括采样,上机,数据处理与分析


PCA(主成分分析)是最常用的无师监督方法,将分散于一组变量上的信息集中于几个综合指标(PC)上,利用主成分描述机体代谢的变化情况,发挥降维分析作用,避免主要成分淹没于大量数据中。


PLS-DA(偏最小二乘判别分析)属于有师监督方法,用于建立类别间的数学模型,使各类样品达到最大的分离,并以VIP 分析(变量投影重要性指标)筛选对分类有贡献的关键代谢物。