基因相互作用网络构建

研究者感兴趣的基因往往同时参与多个通路,此外基因产物间也存在复杂的相互作用关系,这种交叉效应构成了复杂的调控网络。

我们将已有的Intact,Reactome,DIP,BioGRID,MINT,KEGG等多个数据库的蛋白质相互作用关系以及转录因子作用信息整合,通过相互作用网络构建,可以轻松的确定处于核心地位的调控基因。另外,如果差异表达的基因比较多,研究者希望通过宏观的层面看到差异表达基因影响的pathways之间的相互作用关系,来确定感兴趣的pathway。我们将构建pathways的相互作用网络,帮助研究者找到差异的核心pathway,以及各pathway之间的调控关系。


上图为基因相关作用网络,不同颜色的线表示不同种类的作用关系,不同颜色的节点代表不同的pathway,同时节点越大表示与该基因相关作用的关系越多。